福建省中药学重点实验室获批建设时间2013年3月，实验室位于我校旗山校区至善楼，总面积约2500㎡。实验室围绕中药临床药学、中药资源与鉴定、中药化学与分析、中药药理与毒理、中药新制剂与新技术等5个研究方向开展中药药性与合理用药、中药资源品质评价与可持续利用、中药药效物质基础与作用机制、中药质量分析评价及中药新型递药系统及中药新剂型新药研发等研究。
实验室拥有仪器设备647台，价值4164.40万元，50万元以上仪器共有14台，包液相色谱质谱联用仪、全自动药物靶点垂钓系统、高通量细胞分析系统、高效毛细管电泳系统等大型精密科研实验仪器。
实验室现有固定人员49人，平均年龄45岁，其中高级职称45人，博士学位36人。拥有“全球前2%顶尖科学家榜单”、闽江学者、省“双百计划”领军人才、省百千万人才、省“雏鹰计划”青年拔尖人才及省优秀教师等，是一支以博士为主体，年龄结构、学缘结构合理，具有较强创新能力和发展潜力的科研团队。
近五年承担国家级项目17项、企业委托项目17项，在国内核心期刊发表论文120余篇，发表SCI论文70余篇，IF≥5、JCR 分布Q1区30篇；获国家专利授权54项，软件著作权3项；制定省级标准2项、行业标准17项；主编《福建滨海沙生药用植物图鉴》《经方百药》等专著8部；成果获福建省科学技术进步奖二等奖2项，中国民族医药协会科学技术进步奖等科研奖10项。
实验室围绕中药种植技术的提升、中药研发等内容，组织科技人员为本省企业开展各种形式的服务和合作，充分发挥与聚合校企各自的特色,做到优势互补，建立和完善以企业为主体、市场为导向、产学研相结合的技术创新体系。