福建中医药大学中医证研究基地成立于2007年，占地2500平方米，是福建省重点建设高校“海西”建设项目之一。基地为中华中医药学会中医诊断学分会主任委员单位和世界中医药学会联合会健康管理专业委员会会长单位，拥有国家级教学团队和国家级精品资源共享课，依托中医药管理局中医诊断学重点学科和中医健康管理学科，下设9个研究中心。目前，基地有1个国家中医药管理局中医健康状态辨识重点研究室、1个国家中医药管理局三级科研实验室、3个国家中医药管理局二级科研实验室、1个国家中医药管理局继续教育基地、1个福建省级重点实验室、1个福建省2011中医健康管理协同创新中心和1个数字福建中医健康管理大数据研究所。近5年，共承担国家级及省部级重大研究课题30余项。
基地依托中医诊断学和中医健康管理学两个优势特色学科，构建了四诊信息采集技术研究、健康状态辨识与数据挖掘研究、证的生物学基础研究、病证规范化与标准化研究、数字福建中医健康管理大数据研究等5个研究平台，围绕中医健康认知与状态辨识、中医证的基础与临床研究、四诊信息采集及标准化研究、中医辨证思维与证素辨证研究、中医健康管理产品、中医健康管理技术与标准、中医健康管理服务模式与应用示范等数个稳定的研究方向开展科学研究。在辨证思维、健康状态辨识、四诊采集标准等研究领域达到国内领先水平，并以此为基础，构建中医健康管理超级大脑，联通基层社区卫生服务站和中医诊所，实现低成本、广覆盖、高质量的中医健康管理服务。
中医健康管理太空舱为基地最新研究成果，该成果通过集合舌面信息采集系统、脉像信息采集系统、声音采集系统、问诊系统等多源数据，进行后台智能处理，分析得出个体健康状态，生成状态报告，提供风险预警以及自助方案，实现对人体健康状态实时、动态、整体地把握，先后参加香港“创科博览”、国家卫生计生委“中医中药中国行”、6·18海峡项目成果交易会等活动。